More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1376 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.82 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.92 
 
 		 65 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  77.27 
 
 		 66 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 		 66 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  72.73 
 
 		 66 aa  102  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  73.02 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  74.19 
 
 		 65 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  67.19 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1878  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 65 aa  98.6  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 65 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  75.81 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 65 aa  97.1  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  72.31 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  66.18 
 
 		 68 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  73.02 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  74.19 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  70.97 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  70.97 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  70.97 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  73.02 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  70.97 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  70.97 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  70.97 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  73.02 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  67.69 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  70.97 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  73.02 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  73.02 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  73.02 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  73.02 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  71.43 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.21 
 
 		 66 aa  94.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  69.7 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  74.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  69.35 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>