37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0491 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  27.33 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  27 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  26.95 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  26.96 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  23.53 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  25.98 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 
509 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  32.28 
 
 
343 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  23.4 
 
 
350 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  25.68 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  27.78 
 
 
800 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  23.4 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  23.94 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  22.35 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  25.88 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 
349 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 
349 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
335 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  26.56 
 
 
351 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  21.08 
 
 
353 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  27.34 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  23.46 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  27.56 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  26.88 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.24 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  30.1 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  25.64 
 
 
339 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  22.66 
 
 
316 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>