More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0217 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0217  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  699    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  28.98 
 
 
340 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3479  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.784291  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  29.43 
 
 
340 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
340 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.14 
 
 
340 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1690  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.93 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.65 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
337 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  28.81 
 
 
341 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
341 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  26.01 
 
 
352 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  27.62 
 
 
340 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  29.12 
 
 
341 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  27.35 
 
 
338 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  29.13 
 
 
343 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  28.85 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  28.13 
 
 
342 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  28.02 
 
 
341 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  28.21 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  28.21 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  28.21 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  27.57 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  25.99 
 
 
343 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  28.13 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  26.8 
 
 
343 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  27.73 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.21 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  28.02 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  24.71 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
342 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  26.65 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  26.98 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  27.02 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  26.98 
 
 
345 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  25.92 
 
 
342 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  28.13 
 
 
342 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  26.57 
 
 
345 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  28.13 
 
 
342 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  28.13 
 
 
342 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.86 
 
 
341 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.08 
 
 
358 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  27.02 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  26.36 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  26.7 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  26.57 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  26.74 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  26.74 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  26.74 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  26.74 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  27.58 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  26.46 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  26.46 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  26.57 
 
 
341 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.61 
 
 
340 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  26.87 
 
 
339 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 
341 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  26.46 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  26.86 
 
 
343 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  25.29 
 
 
348 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  25.29 
 
 
342 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.84 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  26.61 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  26.61 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  26.61 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  26.61 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  26.61 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>