41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1013 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  78.57 
 
 		 127 aa  193  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  56.35 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  52.03 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  50.79 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  50 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  41.82 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  39.25 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  37.7 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  40.54 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  39.81 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  39.81 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  39.22 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  37.25 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  37.27 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  30.63 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  33.9 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  33.01 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  32.04 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  30.58 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  30.91 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  29.51 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  31.13 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  32.69 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  30 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  28.3 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  30.1 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  28.57 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  28.57 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  27.37 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  27.68 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  29.35 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  29.79 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0064  hypothetical protein  31.91 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  29 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  27.27 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  26.36 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  29.66 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  36.67 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>