21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3764 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3764  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  44 
 
 		 1394 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.2 
 
 		 1831 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  38.69 
 
 		 14609 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 462 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1487 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  41.61 
 
 		 767 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 		 1188 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  41.94 
 
 		 2117 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  35.07 
 
 		 692 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  33.07 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1316 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  40 
 
 		 654 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  46.15 
 
 		 3027 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  38.89 
 
 		 830 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  52 
 
 		 593 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  53.66 
 
 		 843 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  20.12 
 
 		 754 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  40.16 
 
 		 1332 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.96 
 
 		 2031 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  47.5 
 
 		 1908 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>