18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1259 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  100 
 
 
734 aa  1404    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  29.13 
 
 
888 aa  96.3  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.85 
 
 
1991 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.09 
 
 
381 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  30.81 
 
 
943 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  31.55 
 
 
2066 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  26.63 
 
 
425 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  30.91 
 
 
646 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.34 
 
 
1565 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  21.5 
 
 
1280 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  37 
 
 
1916 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  33.17 
 
 
661 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.12 
 
 
3563 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  31.85 
 
 
1134 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.61 
 
 
1183 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  26.42 
 
 
841 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  27.47 
 
 
740 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  30.08 
 
 
1585 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>