74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1003 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 339 aa  681    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  59.46 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  60.54 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  58.91 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  57.99 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  57.66 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  57.83 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  59.23 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  58.46 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  58.82 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  58.58 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  55.76 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  57.4 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  57.1 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  60.24 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  55.26 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  55.26 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  54.95 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  54.97 
 
 		 359 aa  362  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  55.15 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  56.16 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  58.33 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  54.52 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  56.1 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  55.45 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  58.04 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  55.52 
 
 		 343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  56.97 
 
 		 346 aa  351  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  52.65 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  53.24 
 
 		 343 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  52.63 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  53.69 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  52.17 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  51.74 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  53.19 
 
 		 341 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  54.35 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  51.79 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  51.79 
 
 		 336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  51.34 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  51.98 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  52.28 
 
 		 341 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  53.61 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  54.15 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.31 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  54.36 
 
 		 327 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  48.77 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.39 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  47.11 
 
 		 401 aa  293  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  49.08 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  49.7 
 
 		 355 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  45.14 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  38.71 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  44.84 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.45 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.15 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.15 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.43 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.26 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.22 
 
 		 296 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.31 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.71 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.79 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.28 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.84 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.93 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.85 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.05 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.98 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.23 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>