23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0894 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0894  cytochrome c-554 precursor  100 
 
 		 240 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2660  cytochrome c-554 precursor  57.82 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1084  cytochrome c-554 precursor  57.82 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0803  cytochrome c-554 precursor  57.82 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2582  cytochrome c-554 precursor  41.25 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.579805  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2434  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  32.65 
 
 		 590 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.189389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 		 821 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.73 
 
 		 974 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2775  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2682  hypothetical protein  30.34 
 
 		 181 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2482  hypothetical protein  29.66 
 
 		 561 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  0.0219779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2062  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0249  cytochrome c family protein  28.36 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000623647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2868  hypothetical protein  29.86 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2262  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5591  hypothetical protein  31 
 
 		 171 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  27.86 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2858  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  29.53 
 
 		 490 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2673  hypothetical protein  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  29.51 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  29.81 
 
 		 488 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  33.8 
 
 		 391 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>