21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0124 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  31.94 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  32 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  30.14 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  34.06 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  34.97 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  34.06 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  36.89 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  36.89 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  27.78 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  28.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  32.35 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  31.37 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  32.98 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  32.98 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  23.61 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  23.61 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  21.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  24.5 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  21.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3537  putative CheW protein  31.62 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>