79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_AR0030 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_AR0030  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.282956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0045  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  97.78 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0004  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0061  tRNA-Val  90.38 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.154596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0053  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0066  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.011758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0012  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500744  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  84.38 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0055  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623163  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0044  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0053  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0054  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>