196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0053 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_R0053  tRNA-OTHER  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0044  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0056  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805133  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0059  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000131386  normal  0.0398666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0057  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000113368  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0058  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000101774  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0060  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000118562  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0054  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000293035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0058  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000107196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0110  tRNA-Val  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t039  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000279431  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3089t  tRNA-Val  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0033  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000154108  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0029  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.342231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0115  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1117t  tRNA-Val  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00968485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0061  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00024378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0066  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000106688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0026  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00167202  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0062  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0060  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000229541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0068  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0067  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000378114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0028  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.337243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0027  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000568482  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0030  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000589005  normal  0.351876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0032  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000487693  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0031  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3082t  tRNA-Val  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0006696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3188t  tRNA-Val  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0373931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0034  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000784133  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0083  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0116  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000516317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0120  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0119  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0122  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000703597  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0118  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0117  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000194506  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0039  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000106718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0078  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000285873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0065  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000940035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0070  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0069  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0064  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>