43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1121 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  100 
 
 
195 aa  408  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  56.59 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  57.38 
 
 
188 aa  224  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  52.38 
 
 
183 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  52.38 
 
 
183 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  50.9 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  48.81 
 
 
183 aa  171  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  49.4 
 
 
182 aa  161  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  49.4 
 
 
182 aa  161  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  47.56 
 
 
183 aa  160  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  36.17 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  38.03 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  32.67 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  29.37 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  32.67 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  30.97 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 
164 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  33.33 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.28 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  31.75 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  30.16 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  27.54 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  24.84 
 
 
174 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  30.6 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  30.68 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  31.68 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  32.63 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  31.68 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  29.67 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  31.68 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  31.68 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  33.67 
 
 
190 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  27.56 
 
 
148 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  25.5 
 
 
191 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  34.38 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>