47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3696 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3696    100 
 
 
209 bp  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  96.88 
 
 
1812 bp  56  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  94.29 
 
 
759 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  96.77 
 
 
1668 bp  54  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  96.67 
 
 
753 bp  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  96.67 
 
 
753 bp  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
831 bp  50.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  96.55 
 
 
936 bp  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  96.55 
 
 
753 bp  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  96.55 
 
 
867 bp  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  96.55 
 
 
771 bp  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  96.43 
 
 
1515 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  96.43 
 
 
1509 bp  48.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  90 
 
 
747 bp  48.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  96.43 
 
 
1515 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  96.43 
 
 
1785 bp  48.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  96.43 
 
 
1515 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  96.43 
 
 
1515 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  96.43 
 
 
915 bp  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  96.43 
 
 
966 bp  48.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  96.43 
 
 
1026 bp  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  93.75 
 
 
1662 bp  48.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  96.43 
 
 
1515 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  93.75 
 
 
1662 bp  48.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  93.75 
 
 
1662 bp  48.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5874  ABC transporter related protein  96.3 
 
 
687 bp  46.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  96.3 
 
 
792 bp  46.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  93.55 
 
 
750 bp  46.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  93.55 
 
 
747 bp  46.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  96.3 
 
 
747 bp  46.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  96.3 
 
 
726 bp  46.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  93.55 
 
 
795 bp  46.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  96.3 
 
 
2073 bp  46.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  93.55 
 
 
771 bp  46.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  96.3 
 
 
744 bp  46.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
798 bp  46.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  96.3 
 
 
1827 bp  46.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  96.3 
 
 
714 bp  46.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  96.3 
 
 
1737 bp  46.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  96.3 
 
 
1827 bp  46.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  96.3 
 
 
1812 bp  46.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  96.3 
 
 
720 bp  46.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  93.55 
 
 
1602 bp  46.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  93.55 
 
 
933 bp  46.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  93.55 
 
 
1911 bp  46.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  93.55 
 
 
717 bp  46.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  91.43 
 
 
648 bp  46.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>