26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3009 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
337 aa  643    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  56.36 
 
 
328 aa  319  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  36.04 
 
 
410 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  30.26 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  32.52 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  30.37 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  29.91 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  31.03 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  30.29 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  26.69 
 
 
295 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  31.33 
 
 
330 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  27.35 
 
 
325 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  29.22 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  27.67 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  30.34 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  25.31 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  27.51 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  29.33 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  30.04 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  30.79 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  22.96 
 
 
774 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  33.22 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  24.65 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  33.08 
 
 
186 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  26.07 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  26.8 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>