69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2770 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 
154 aa  298  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  83.92 
 
 
133 aa  225  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  68.79 
 
 
132 aa  186  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  65.49 
 
 
136 aa  173  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  63.83 
 
 
138 aa  166  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  47.14 
 
 
134 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  49.29 
 
 
138 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.89 
 
 
137 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.86 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.01 
 
 
155 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  57.14 
 
 
67 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  53.12 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  50 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  50.79 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  51.61 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  47.62 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  47.62 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  47.62 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  51.67 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  48.33 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  42.62 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  41.43 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  41.43 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  52.63 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  45 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45 
 
 
262 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30.47 
 
 
208 aa  51.2  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  50.82 
 
 
273 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  44.07 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  39.34 
 
 
454 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  38.6 
 
 
457 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40.98 
 
 
255 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.9 
 
 
261 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.29 
 
 
202 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  42.22 
 
 
455 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  40.43 
 
 
456 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  42.22 
 
 
455 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.18 
 
 
202 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1622  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.33 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1021  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  29.89 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
458 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  45.76 
 
 
448 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35 
 
 
458 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
458 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  39.34 
 
 
458 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
458 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
458 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3330  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  32.18 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  43.14 
 
 
473 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
458 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
460 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  39.34 
 
 
454 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  39.34 
 
 
458 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  39.34 
 
 
454 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  38.81 
 
 
256 aa  43.9  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
458 aa  43.9  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.8 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  35.53 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  47.69 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  36.36 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
407 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  37.29 
 
 
465 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  36.84 
 
 
203 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
471 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1390  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  29.89 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 
436 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  37.7 
 
 
203 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.68 
 
 
203 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.487297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>