218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4626 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  81.72 
 
 
343 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  62.31 
 
 
343 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  62.31 
 
 
343 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  50.37 
 
 
344 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.13 
 
 
343 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.39 
 
 
342 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.39 
 
 
342 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.13 
 
 
343 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.76 
 
 
367 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.15 
 
 
343 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.15 
 
 
343 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
340 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
340 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  48.5 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  48.5 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  48.5 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  48.5 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  48.5 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.91 
 
 
345 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.57 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 
348 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 
348 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  43.13 
 
 
374 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.54 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
348 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.42 
 
 
348 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  42.16 
 
 
350 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.04 
 
 
360 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.26 
 
 
362 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.26 
 
 
362 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.26 
 
 
362 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.26 
 
 
362 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.26 
 
 
362 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.26 
 
 
362 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  40.52 
 
 
362 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  40.52 
 
 
362 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  40.52 
 
 
362 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  40.52 
 
 
362 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  40.52 
 
 
362 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  40.52 
 
 
362 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  40.37 
 
 
363 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.96 
 
 
342 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.93 
 
 
226 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  33.82 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.07 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.82 
 
 
374 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  33.82 
 
 
348 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.04 
 
 
226 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.45 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.45 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.45 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.45 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  33.45 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  44.27 
 
 
193 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  31.95 
 
 
185 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4230  hypothetical protein  68.33 
 
 
128 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0416635  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3153  hypothetical protein  43.24 
 
 
115 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.740304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  29.86 
 
 
370 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  37.24 
 
 
145 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3186  hypothetical protein  38.68 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.271971  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.92 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>