More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3447 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0776  nitrate reductase, beta subunit  96.3 
 
 		 513 aa  1046    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0965  nitrate reductase, beta subunit  94.93 
 
 		 513 aa  1035    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1021  respiratory nitrate reductase beta subunit  60.94 
 
 		 495 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0219724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3289  nitrate reductase, beta subunit  97.47 
 
 		 513 aa  1049    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0366444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3447  nitrate reductase, beta subunit  100 
 
 		 513 aa  1070    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.338628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0249  nitrate reductase, beta subunit  55.36 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0794164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1707  nitrate reductase, beta subunit  57.03 
 
 		 489 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2171  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.83 
 
 		 489 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1778  nitrate reductase, beta subunit  56.83 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3596  nitrate reductase, beta subunit  54.66 
 
 		 485 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.989414  hitchhiker  0.00578955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0330  respiratory nitrate reductase beta subunit  51.46 
 
 		 484 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000947818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2653  nitrate reductase, beta subunit  51.17 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0204  nitrate reductase, beta subunit  52.83 
 
 		 483 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.92 
 
 		 519 aa  527  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  49.79 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  49.79 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  51.56 
 
 		 538 aa  518  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  51.12 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  49.69 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  50.21 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  51.12 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  50.31 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  50.1 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  49.38 
 
 		 491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.49 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  49.59 
 
 		 491 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.18 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  50.31 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2563  nitrate reductase, beta subunit  49.49 
 
 		 526 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.219969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2882  nitrate reductase, beta subunit  49.69 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  50.1 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  50.1 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  48.87 
 
 		 504 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  50.41 
 
 		 525 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  50.31 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  51.59 
 
 		 550 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  49.69 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  50.31 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  49.59 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  49.79 
 
 		 517 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  49.9 
 
 		 521 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  48.76 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  49.27 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  49.49 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2063  respiratory nitrate reductase beta subunit  50.31 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  50.83 
 
 		 513 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  49.17 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  49.17 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1404  respiratory nitrate reductase beta subunit  47.95 
 
 		 522 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314304  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  49.17 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  49.17 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  49.17 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  49.79 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  48.97 
 
 		 517 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.59 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.59 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  49.06 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  49.17 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  49.17 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  49.17 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  49.9 
 
 		 520 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  50.41 
 
 		 489 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.88 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  49.79 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  49.79 
 
 		 508 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  50.62 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  48.97 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  49.17 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  49.28 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  48.97 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  48.45 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.97 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  49.39 
 
 		 512 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.15 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  48.97 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  49.59 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  49.59 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.87 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  50.72 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2634  nitrate reductase, beta subunit  46.98 
 
 		 523 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.832447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  48.97 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  48.97 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  48.97 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  48.97 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  48.87 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0498  nitrate reductase, beta subunit  48.76 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  49.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  48.66 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  49.69 
 
 		 507 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  49.38 
 
 		 507 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  50.32 
 
 		 558 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  48.55 
 
 		 508 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  48.66 
 
 		 511 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  49.59 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>