201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3076 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3076  transposase  100 
 
 
478 aa  981    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  65.41 
 
 
427 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  60.29 
 
 
439 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  60.57 
 
 
443 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  60.57 
 
 
443 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  59.26 
 
 
453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  59.26 
 
 
453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  59.26 
 
 
453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  59.26 
 
 
453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  59.34 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  60.77 
 
 
445 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  59.24 
 
 
430 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  59.67 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  54.08 
 
 
453 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  55.74 
 
 
453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  54.11 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  53.86 
 
 
463 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
460 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  49.78 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  49.78 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  49.78 
 
 
460 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
453 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
460 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
460 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
460 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
460 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
460 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
460 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
501 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
460 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  49.55 
 
 
460 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  49.78 
 
 
460 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
469 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
460 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
467 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
460 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
747 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
460 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  52.26 
 
 
800 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
483 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  52.26 
 
 
460 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  49.11 
 
 
473 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
544 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
460 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
460 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
460 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
483 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
483 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  52.51 
 
 
550 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  52.26 
 
 
460 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
747 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
460 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  49.33 
 
 
460 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  52.26 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  51.75 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  52.01 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  51.75 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  48.88 
 
 
473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  52.01 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  49.11 
 
 
460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  52.26 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  51.75 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  49.11 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  51.76 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  48.44 
 
 
462 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  52.01 
 
 
460 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  51.76 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  48.98 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  49.64 
 
 
412 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  53.02 
 
 
403 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  49.28 
 
 
403 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  52.75 
 
 
426 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  51.05 
 
 
405 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  51.05 
 
 
405 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  49.87 
 
 
382 aa  364  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  49.22 
 
 
375 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  50.72 
 
 
338 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04846  ISXo8 transposase  50.15 
 
 
347 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  54.86 
 
 
328 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  49.42 
 
 
470 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02542  ISXo8 transposase  49.42 
 
 
495 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  54.51 
 
 
351 aa  319  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02155  ISXo8 transposase  54.17 
 
 
328 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02315  ISXo8 transposase  49.67 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00295  isrso17-transposase protein  52.92 
 
 
319 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00607053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02022  ISXo8 transposase  47.24 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01499  ISXo8 transposase  47.24 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.709991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02784  ISXo8 transposase  46.9 
 
 
313 aa  249  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  40 
 
 
451 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00369  ISXo8 transposase  48.66 
 
 
286 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  40 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  40 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  40 
 
 
458 aa  239  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04444  ISXo8 transposase  50.61 
 
 
293 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00548  ISXo8  49.19 
 
 
330 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06262  ISXo8 transposase  50.61 
 
 
269 aa  237  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01108  ISXo8 transposase  50.61 
 
 
269 aa  237  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05574  ISXo8 transposase  48.28 
 
 
286 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03793  ISXo8 transposase  48.28 
 
 
286 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>