183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00548 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00548  ISXo8  100 
 
 
330 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02542  ISXo8 transposase  98.93 
 
 
495 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  97.53 
 
 
470 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
460 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
460 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
460 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  94.72 
 
 
800 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
460 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
460 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
460 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  95.1 
 
 
375 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
462 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  92.58 
 
 
460 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
460 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
460 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
460 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  99.57 
 
 
328 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
469 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
460 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
403 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
467 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
460 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
550 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
460 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  94.69 
 
 
460 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
501 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  94.69 
 
 
382 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
460 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
460 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
412 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
460 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  99.14 
 
 
483 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
467 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
460 aa  471  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  94.69 
 
 
453 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
747 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04846  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  94.29 
 
 
405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  94.29 
 
 
473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  98.28 
 
 
351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  93.88 
 
 
432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  98.71 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  93.88 
 
 
473 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  94.29 
 
 
405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
747 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  97.85 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  98.28 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02155  ISXo8 transposase  97.42 
 
 
328 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  93.88 
 
 
403 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02315  ISXo8 transposase  98.03 
 
 
337 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02022  ISXo8 transposase  99.41 
 
 
327 aa  347  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01499  ISXo8 transposase  99.41 
 
 
313 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.709991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02784  ISXo8 transposase  98.82 
 
 
313 aa  346  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02646  ISXo8 transposase  99.28 
 
 
243 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04444  ISXo8 transposase  99.28 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00369  ISXo8 transposase  98.56 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03793  ISXo8 transposase  97.84 
 
 
286 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05574  ISXo8 transposase  97.84 
 
 
286 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06248  ISXo8 transposase  98.55 
 
 
287 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0177744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06262  ISXo8 transposase  98.55 
 
 
269 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01070  ISXo8 transposase  98.55 
 
 
287 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01108  ISXo8 transposase  98.55 
 
 
269 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000155134  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
443 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
445 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
443 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
453 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
453 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
453 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  47.44 
 
 
453 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  55.08 
 
 
431 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01539  ISXo8 transposase  98.35 
 
 
216 aa  248  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0768502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  51.21 
 
 
430 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  49.19 
 
 
439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  49.19 
 
 
478 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  50.42 
 
 
453 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  50.42 
 
 
453 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  47.79 
 
 
439 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  48.43 
 
 
469 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  49.58 
 
 
463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00268  ISXo8 transposase  98.04 
 
 
197 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  45.02 
 
 
427 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>