33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1388 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  79.85 
 
 		 267 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  65.68 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  63.57 
 
 		 256 aa  314  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  63.06 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  61.57 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  62.96 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  45.96 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  39.19 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  52.67 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  36.9 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  36.94 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  49.22 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  45.22 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  37.4 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  37.96 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  29.13 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  29.69 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  27.1 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  28.35 
 
 		 169 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  26.89 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  29.2 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  28.99 
 
 		 176 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  29.45 
 
 		 229 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  34.82 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  28.72 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  28.72 
 
 		 164 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  28.75 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  25 
 
 		 439 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  23.91 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  29.53 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  23.58 
 
 		 169 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>