166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1328 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  79.89 
 
 
183 aa  270  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  55.93 
 
 
179 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  56.35 
 
 
176 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  54.7 
 
 
176 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  51.7 
 
 
175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  53.89 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.33 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.26 
 
 
173 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.63 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.94 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  42.37 
 
 
176 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.94 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.81 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.95 
 
 
172 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.2 
 
 
183 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.5 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.29 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.36 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.31 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.3 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.63 
 
 
177 aa  90.9  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  36.93 
 
 
166 aa  87.8  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  30.29 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.8 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.47 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  38.64 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.43 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.03 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3521  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.79 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000585332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  34.09 
 
 
166 aa  84.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  35.62 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.58 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.09 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  34.09 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.29 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.3 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.56 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.56 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.76 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.56 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.11 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  27.27 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.08 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.64 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.47 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.75 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  37.99 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.57 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.34 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.77 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.71 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.78 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.71 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.39 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4437  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.4 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.76 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  28.74 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.07 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.51 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.14 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0091  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.94 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.57 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.36 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  33.71 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.38 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.53 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  31.79 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.31 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  29.21 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  34.48 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2254  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.3 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  28.09 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  28.65 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.71 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  32.08 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.1 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.68 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
158 aa  62  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1688  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.97 
 
 
173 aa  60.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.22 
 
 
445 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0088  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.86 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.01 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.01 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  37.69 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.61 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.31 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  23.43 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>