171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0853 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  307  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  85.03 
 
 
147 aa  275  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  80.27 
 
 
147 aa  258  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5150  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  77.55 
 
 
147 aa  247  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2631  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  74.83 
 
 
147 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  71.43 
 
 
147 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.171783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  72.03 
 
 
150 aa  223  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7185  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  68.53 
 
 
148 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  66.89 
 
 
149 aa  217  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.34 
 
 
148 aa  216  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  66.43 
 
 
148 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  65.07 
 
 
148 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.83 
 
 
149 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  65.03 
 
 
149 aa  209  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  63.95 
 
 
147 aa  209  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  65.73 
 
 
148 aa  209  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.43 
 
 
156 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3535  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  62.76 
 
 
147 aa  207  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  65.03 
 
 
148 aa  204  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.34 
 
 
149 aa  203  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4801  hypothetical protein  63.64 
 
 
148 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.54 
 
 
154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  60.56 
 
 
151 aa  186  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3671  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  55.24 
 
 
150 aa  176  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0834588 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  52.82 
 
 
146 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1890  activator of Hsp90 ATPase family protein  53.1 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2085  activator of Hsp90 ATPase family protein  52.41 
 
 
149 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2210  activator of Hsp90 ATPase family protein  51.08 
 
 
149 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0188  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  36 
 
 
158 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36 
 
 
158 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.67 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4803  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.67 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5344  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.67 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5435  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.84 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.740658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4808  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.33 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.57 
 
 
249 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1654  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5623  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.99 
 
 
153 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1831  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.93 
 
 
156 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948709  hitchhiker  0.00916424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  32.67 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  32.67 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  32.67 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2028  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.93 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.9 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0245007  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1406  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.46 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0663  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0754  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1326  activator of Hsp90 ATPase-like protein  36.04 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.99 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.14 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.14 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.14 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.09 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  29.58 
 
 
360 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1458  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.44 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520072  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.35 
 
 
142 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  29.17 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.71 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.64 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.29 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  30.15 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1121  hypothetical protein  28.76 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0695467  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.56 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4451  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.69 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.45 
 
 
434 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.56 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.56 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.46 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2425  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.43 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152043  normal  0.0111612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
191 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.92 
 
 
168 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.06 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  28.78 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0561  hypothetical protein  27.89 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1719  hypothetical protein  32.87 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.29 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.56 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.03 
 
 
317 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.03 
 
 
317 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.71 
 
 
158 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.43 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.44 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  24.32 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  31.62 
 
 
329 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.68 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.37 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.47 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.47 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  31.3 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.5 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1556  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.17 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00676118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  28.37 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.86 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.78 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  34.57 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>