More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5388 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5388  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
335 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  41.49 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3425  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.99 
 
 
325 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31860  phosphate ABC transporter membrane protein  41.09 
 
 
327 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0659  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.9 
 
 
336 aa  215  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.825746  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  43.83 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  42.39 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.44 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.02 
 
 
336 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.39 
 
 
334 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0363  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.49 
 
 
310 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01620  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  38.87 
 
 
319 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4649  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.41 
 
 
318 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.19 
 
 
319 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.72 
 
 
336 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.53 
 
 
325 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0203  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.49 
 
 
310 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.12 
 
 
324 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.2 
 
 
328 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.12 
 
 
324 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  40.06 
 
 
316 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3542  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.35 
 
 
348 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  40.31 
 
 
320 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37630  phosphate ABC transporter membrane protein  38.79 
 
 
314 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06950  phosphate ABC transporter membrane protein  39.7 
 
 
326 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  42.31 
 
 
326 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.3 
 
 
317 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.11 
 
 
322 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.11 
 
 
322 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2741  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.56 
 
 
320 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0392833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.7 
 
 
325 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.31 
 
 
325 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.34 
 
 
341 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  39.63 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.29 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  39.63 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.51 
 
 
325 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  39.63 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  38.14 
 
 
324 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2081  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.88 
 
 
353 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.601728  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3925  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.34 
 
 
344 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.43 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.07 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  40.13 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.8 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0481  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  39.75 
 
 
325 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  40.13 
 
 
316 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  37.99 
 
 
328 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  37.06 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  38.56 
 
 
329 aa  195  9e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  39.6 
 
 
315 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  41.2 
 
 
324 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.68 
 
 
312 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.2 
 
 
324 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  36.87 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  37.77 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  39.43 
 
 
319 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  36.98 
 
 
337 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  36.87 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  36.87 
 
 
328 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  39.08 
 
 
318 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4901  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.31 
 
 
349 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  43.49 
 
 
331 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  37.39 
 
 
343 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.24 
 
 
316 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4518  phosphate ABC transporter permease  40.31 
 
 
349 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.31 
 
 
349 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.35 
 
 
369 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
312 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
328 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
312 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  37.34 
 
 
312 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6820  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.1 
 
 
352 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.62 
 
 
324 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.37 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.81 
 
 
694 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 
331 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2332  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  37.91 
 
 
316 aa  189  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2805  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.51 
 
 
319 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0222  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.16 
 
 
334 aa  188  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.49 
 
 
328 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  39.86 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>