34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4913 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  100 
 
 		 63 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  60 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  52.73 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  52.73 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  50.91 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  49.09 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  52.73 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  51.85 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  50.91 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  52.73 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  52.73 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  52.73 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  49.09 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  44.83 
 
 		 58 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  43.64 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  50.91 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  45.45 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  41.38 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  44.83 
 
 		 58 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  42.59 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  43.1 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  46.3 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  34.43 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  47.27 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  44.44 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  45.45 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  40 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  50 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  44.23 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  45.1 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>