More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2484 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2484  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.585223  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3267  short chain enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.19 
 
 
243 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3062  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.31 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.92 
 
 
254 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0173  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.33 
 
 
247 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00691554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20230  short chain enoyl-CoA hydratase  50.98 
 
 
261 aa  225  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 
261 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1374  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.548456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.93 
 
 
260 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
267 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.32 
 
 
659 aa  153  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
259 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
267 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.6 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.7 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
260 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
258 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
259 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.55 
 
 
662 aa  142  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
257 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
262 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
257 aa  141  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.15 
 
 
258 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  36.29 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.46 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.56 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
257 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 
258 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.39 
 
 
260 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.85 
 
 
275 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.56 
 
 
256 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
254 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
257 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
258 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
258 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
261 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
257 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  36.73 
 
 
269 aa  136  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
260 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.51 
 
 
662 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.95 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.15 
 
 
662 aa  135  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.33 
 
 
260 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
256 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.68 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.08 
 
 
661 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
258 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
259 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 
258 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
256 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.3 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
268 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
260 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.27 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
259 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
260 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
257 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
261 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>