42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0140 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  100 
 
 		 823 aa  1671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  82.8 
 
 		 827 aa  1376    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  79.23 
 
 		 816 aa  1323    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  78.06 
 
 		 830 aa  1326    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  80.25 
 
 		 821 aa  1328    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  26.72 
 
 		 846 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4735  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1114 aa  255  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000107106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4299  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1056 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.511127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0484  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1201 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0181373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  28.02 
 
 		 819 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07280  hypothetical protein  27.49 
 
 		 980 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0886  hypothetical protein  26.77 
 
 		 955 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  26.67 
 
 		 792 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  26.55 
 
 		 856 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  25.04 
 
 		 805 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  27.7 
 
 		 807 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2001  conjugal transfer protein, interruption-C  24.07 
 
 		 756 aa  138  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.05 
 
 		 802 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1167  hypothetical protein  25.49 
 
 		 826 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.42 
 
 		 802 aa  131  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1037  conjugal transfer protein, ATPase  23 
 
 		 832 aa  94.4  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0639  hypothetical protein  25.5 
 
 		 920 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5541  hypothetical protein  22.53 
 
 		 832 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696223 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5943  hypothetical protein  22.53 
 
 		 832 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.03 
 
 		 864 aa  57.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2720  hypothetical protein  23.45 
 
 		 442 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146207  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.6 
 
 		 608 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.19 
 
 		 629 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.47 
 
 		 629 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.14 
 
 		 569 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5543  hypothetical protein  25.98 
 
 		 818 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0823  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.85 
 
 		 522 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.38 
 
 		 501 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.57 
 
 		 868 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.28 
 
 		 521 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  23.13 
 
 		 827 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4631  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1028 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  28.25 
 
 		 629 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.42 
 
 		 595 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.46 
 
 		 785 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  32.93 
 
 		 819 aa  44.3  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3654  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.38 
 
 		 500 aa  44.3  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>