91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4994 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  100 
 
 
120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  61.67 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  61.67 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  61.67 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  64.22 
 
 
166 aa  143  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  60.98 
 
 
158 aa  138  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  59.17 
 
 
155 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  61.11 
 
 
168 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  62.26 
 
 
182 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  61.67 
 
 
165 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  57.63 
 
 
166 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  60.75 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  58.33 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  64.71 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  62.16 
 
 
155 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  67.59 
 
 
160 aa  120  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  60.58 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  56.73 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  48.28 
 
 
145 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  49.11 
 
 
164 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  46.61 
 
 
178 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  49.51 
 
 
162 aa  100  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  45.19 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  42.06 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  42.72 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  45.54 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  42.42 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  43.52 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  43.64 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  44.57 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  44.12 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  41.74 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  42 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  42 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  36.67 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  44.16 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  38.61 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  40.22 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  39.8 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  33 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  31 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  39.77 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  33.01 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  31.78 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  39.33 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  36.05 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  37.5 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  30.84 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  30.84 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  33.68 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  32.73 
 
 
130 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  26.36 
 
 
175 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  36 
 
 
201 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  29.29 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  31.52 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  38.24 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  30.43 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  37.23 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  35.87 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  34.48 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  28.43 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  34.09 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  33.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  31.63 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  26.8 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  26.8 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  27.88 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  30.53 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  30.21 
 
 
129 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  29 
 
 
170 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  29.03 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1186  hypothetical protein  36.36 
 
 
277 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  32.41 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1086  hypothetical protein  27.17 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2439  protein of unknown function DUF322  40.58 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>