86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1086 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1086  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  83.33 
 
 
120 aa  206  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  83.33 
 
 
120 aa  206  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  38.74 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  37.14 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  32.73 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  36.04 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  34.86 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  31.82 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  33.03 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  38.26 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  34.62 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  34.86 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  31.86 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  31.19 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  31.19 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  33.96 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  32.11 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  30.56 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  35.29 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  30.56 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  28.32 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  30.91 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  26.67 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  26.67 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  29.36 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  29.07 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  25.47 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  25.93 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  25.45 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  24.55 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  29.03 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  23.64 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09980  hypothetical protein  24.76 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000012497  hitchhiker  0.00000206234 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  25.71 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  22.73 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  25.23 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  25.71 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0758  hypothetical protein  24.07 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  24.53 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  21.82 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  29.57 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  21.7 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1089  hypothetical protein  25.44 
 
 
114 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  26.42 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  29.91 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05570  hypothetical protein  20.18 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.579477  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  25.23 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  24.04 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  28.04 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  24.32 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1053  hypothetical protein  29.52 
 
 
109 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1743  hypothetical protein  24.07 
 
 
116 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1059  hypothetical protein  29.52 
 
 
109 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214428  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  19.09 
 
 
120 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  21.7 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1033  protein of unknown function DUF322  25.74 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3339  hypothetical protein  28.18 
 
 
274 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.892832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1284  hypothetical protein  22.94 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1239  hypothetical protein  30.3 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  27.17 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1309  hypothetical protein  22.94 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2070  hypothetical protein  26.36 
 
 
285 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  23.53 
 
 
159 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>