20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0318 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  46.23 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  49.82 
 
 
312 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  43.34 
 
 
353 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  42.61 
 
 
248 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  34.73 
 
 
321 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  34.34 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  36.65 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  32.61 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  33.99 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  29.52 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  24.91 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  27.14 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  23.15 
 
 
359 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.9 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  23.17 
 
 
328 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  24.13 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  21.84 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  24.79 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>