36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0398 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  100 
 
 
176 aa  353  5.999999999999999e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.78 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_002978  WD0429  ATP synthase F0, B subunit, putative  36.46 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.76 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.59 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.57 
 
 
208 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.57 
 
 
208 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.57 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.25 
 
 
205 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.71 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.83 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.47 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.77 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.37 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  29.31 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  43.14 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.68 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.85 
 
 
167 aa  47  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.5 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  24.53 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.98 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  24.44 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.98 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.51 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.4 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  21.62 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.62 
 
 
185 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.68 
 
 
183 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.27 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.29 
 
 
201 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.29 
 
 
201 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  20 
 
 
204 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  29.85 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.09 
 
 
199 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 
200 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>