More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1903 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1903  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
335 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4458  alcohol dehydrogenase  87.35 
 
 
332 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.47566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1597  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.96 
 
 
332 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1621  alcohol dehydrogenase  60.96 
 
 
332 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  60.96 
 
 
332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.22 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.86 
 
 
588 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.84 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.97 
 
 
325 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
329 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.69 
 
 
327 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
328 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 
345 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.84 
 
 
327 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.78 
 
 
328 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.71 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  47.42 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  50.16 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.31 
 
 
330 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.84 
 
 
329 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  47.17 
 
 
327 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.96 
 
 
328 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.52 
 
 
327 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.58 
 
 
327 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  46.08 
 
 
327 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
327 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.96 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  48.87 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  45.78 
 
 
327 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.23 
 
 
327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.98 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  49.67 
 
 
326 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.84 
 
 
327 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.91 
 
 
327 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48 
 
 
329 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  50.33 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.95 
 
 
334 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.87 
 
 
331 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.5 
 
 
338 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
326 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  48.68 
 
 
326 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
326 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  48.52 
 
 
326 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 
326 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  48.01 
 
 
328 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
326 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  48.2 
 
 
326 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  49.67 
 
 
326 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  49.35 
 
 
327 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
326 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 
326 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  48.72 
 
 
326 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  46.45 
 
 
327 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.38 
 
 
326 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.54 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  47.35 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.54 
 
 
326 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.54 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.87 
 
 
328 aa  261  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 
326 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
333 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.83 
 
 
338 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.34 
 
 
738 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
326 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
328 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  47.15 
 
 
328 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  45.9 
 
 
328 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.56 
 
 
328 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.02 
 
 
324 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.02 
 
 
324 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  45.02 
 
 
324 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.63 
 
 
325 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  45.02 
 
 
324 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.49 
 
 
328 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.37 
 
 
327 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.87 
 
 
336 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  44.69 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  44.69 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.07 
 
 
335 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  44.69 
 
 
324 aa  259  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.21 
 
 
332 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  45.02 
 
 
324 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  45.02 
 
 
324 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  47.02 
 
 
327 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06860  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.68 
 
 
328 aa  258  8e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0708364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.33 
 
 
326 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  47.04 
 
 
327 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.13 
 
 
327 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.52 
 
 
334 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 
326 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  44.68 
 
 
332 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.06 
 
 
329 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.53 
 
 
332 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.59 
 
 
331 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  46.41 
 
 
338 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>