More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1841 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1841  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4517  alcohol dehydrogenase  82.99 
 
 
341 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.986402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  69.5 
 
 
384 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0372  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
348 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1442  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
354 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0102925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
385 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.49 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
422 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  37.24 
 
 
394 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  36.78 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4749  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
393 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.76 
 
 
389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.99 
 
 
394 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.22 
 
 
389 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.45 
 
 
389 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.07 
 
 
425 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
417 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.07 
 
 
492 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.38 
 
 
389 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1803  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.95 
 
 
392 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
401 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1966  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
393 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317258  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
402 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.64 
 
 
385 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.79 
 
 
393 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.19 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.38 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
389 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.7 
 
 
392 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
433 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.7 
 
 
389 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
410 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.91 
 
 
384 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
390 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.7 
 
 
392 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.82 
 
 
397 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 
390 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 
410 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
415 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
384 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.22 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  35.22 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  35.22 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  35.22 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.25 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0885  putative glutathione-dependent aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
391 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.418745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.22 
 
 
412 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.36 
 
 
344 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000105685  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.13 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.36 
 
 
389 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.03 
 
 
393 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
360 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.55 
 
 
382 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.67 
 
 
401 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6610  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.5 
 
 
394 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.965415  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
401 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
346 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
401 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.68 
 
 
384 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5109  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.67 
 
 
392 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5488  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
392 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5197  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
392 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.51 
 
 
341 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.7 
 
 
412 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
357 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.22 
 
 
391 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.9 
 
 
388 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
346 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
386 aa  178  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0344  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.92 
 
 
396 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
374 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.49 
 
 
444 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.45 
 
 
412 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.08 
 
 
386 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
384 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.11 
 
 
387 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
351 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.19 
 
 
412 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  34.19 
 
 
412 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
384 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 
412 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
412 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
392 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.19 
 
 
412 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.71 
 
 
357 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19850  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  35.88 
 
 
400 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.809397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
388 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.68 
 
 
388 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
388 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
403 aa  175  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1589  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 
394 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.75 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.73 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>