13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2689 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2689  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 179 aa  350  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  58.24 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  39.1 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  37.5 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  38.24 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  37.27 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  35.92 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  38.24 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  32.18 
 
 		 132 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  33.05 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  33.11 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0309  peptidase A24A prepilin type IV  24.24 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000294051  normal  0.397426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  32.14 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>