42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2267 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 323 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  67.18 
 
 		 323 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  65.33 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  65.94 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  64.71 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  64.09 
 
 		 323 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  64.09 
 
 		 323 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  57.5 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  54.69 
 
 		 327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  54.69 
 
 		 327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  55.14 
 
 		 330 aa  353  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  55.14 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  55.03 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  53.92 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  54.21 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  54.18 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  55.62 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  56.29 
 
 		 327 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  55.56 
 
 		 327 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  54.09 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  51.71 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  53.56 
 
 		 318 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  56.04 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  55.21 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  55.87 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  51.39 
 
 		 319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.75 
 
 		 322 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  66.26 
 
 		 178 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  60.76 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.56 
 
 		 175 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  57.59 
 
 		 174 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  54.55 
 
 		 172 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.2 
 
 		 163 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  34.42 
 
 		 174 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  34.42 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  20.69 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  32.89 
 
 		 175 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  24.26 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.11 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  30.28 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  23.08 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>