22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1753 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  55.1 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  55 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  58.02 
 
 		 287 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  51.11 
 
 		 267 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  51.11 
 
 		 263 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  56.41 
 
 		 296 aa  93.6  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  58.97 
 
 		 226 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  47.78 
 
 		 263 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  58.44 
 
 		 354 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  53.25 
 
 		 257 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  44.3 
 
 		 265 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  52.63 
 
 		 267 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  51.95 
 
 		 189 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  43.75 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  46.43 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  47.37 
 
 		 265 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  48.1 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  46.34 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  46.84 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  44.16 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>