282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0993 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  75.38 
 
 
140 aa  199  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  72.06 
 
 
134 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  73.85 
 
 
139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.12 
 
 
134 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  69.23 
 
 
133 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.92 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.22 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.15 
 
 
134 aa  177  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.15 
 
 
134 aa  177  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  66.67 
 
 
142 aa  176  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
136 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
136 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
139 aa  168  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.46 
 
 
133 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.91 
 
 
137 aa  163  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.94 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.54 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.14 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.22 
 
 
146 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.36 
 
 
137 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.4 
 
 
133 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.23 
 
 
133 aa  159  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.08 
 
 
135 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.31 
 
 
133 aa  158  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.81 
 
 
142 aa  157  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.24 
 
 
150 aa  156  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.91 
 
 
132 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  64.62 
 
 
134 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 
139 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.65 
 
 
139 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.06 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.94 
 
 
135 aa  146  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.96 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.08 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.21 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.15 
 
 
135 aa  143  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.12 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.14 
 
 
136 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  46.09 
 
 
126 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.45 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.85 
 
 
126 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.44 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.86 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.86 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
130 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
126 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.22 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.11 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.41 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.22 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.35 
 
 
543 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.85 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.54 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.04 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.41 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  41.41 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.09 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.17 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.23 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.2 
 
 
123 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.1 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>