More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0310 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0310  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
328 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  51.52 
 
 
328 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1769  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.28 
 
 
325 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.65 
 
 
324 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5327  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.56 
 
 
334 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4784  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.26 
 
 
334 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5251  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.26 
 
 
334 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1967  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.11 
 
 
324 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  36.27 
 
 
326 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  36.27 
 
 
326 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.49 
 
 
326 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  41.45 
 
 
331 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.7 
 
 
326 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0536  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.23 
 
 
328 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.07 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.65 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  35.87 
 
 
326 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.45 
 
 
325 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.46 
 
 
324 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  36.05 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.31 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.77 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.69 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.27 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.42 
 
 
334 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.9 
 
 
334 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.9 
 
 
334 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.66 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1204  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.05 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.787899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.53 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  38.19 
 
 
313 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.91 
 
 
334 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.94 
 
 
330 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  32.23 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2704  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.02 
 
 
330 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.08 
 
 
320 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04171  magnesium and cobalt transport protein  33.33 
 
 
269 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0560  CorA family protein  32.91 
 
 
353 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.856188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0559  CorA family protein  32.91 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.780327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.84 
 
 
320 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
320 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 
317 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  30.22 
 
 
320 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
317 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
317 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.51 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  32.67 
 
 
316 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.41 
 
 
316 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.41 
 
 
316 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.41 
 
 
316 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2608  Mg2+/Co2+ transporter  32.56 
 
 
331 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.67 
 
 
316 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1266  Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 
331 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.33 
 
 
316 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.23 
 
 
316 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.33 
 
 
316 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.33 
 
 
316 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.33 
 
 
316 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.33 
 
 
316 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  30.6 
 
 
316 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  31.85 
 
 
316 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  30.6 
 
 
316 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
336 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.7 
 
 
315 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.84 
 
 
328 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.36 
 
 
328 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.36 
 
 
328 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0220  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.24 
 
 
321 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3748  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.63 
 
 
328 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1280  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.05 
 
 
327 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.32 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0826  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.36 
 
 
327 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.922261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  29.07 
 
 
317 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0749  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.36 
 
 
327 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.680593  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0241  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.24 
 
 
321 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  29.33 
 
 
316 aa  145  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4572  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.52 
 
 
328 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0227  transport protein  29.85 
 
 
318 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 
315 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.87 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.94 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.41 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.39 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  29.33 
 
 
316 aa  139  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2690  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.33 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.4769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0401  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
328 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.39 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.98 
 
 
317 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>