179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2064 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2064  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 507 aa  987    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0006  sodium/hydrogen exchanger  47.04 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.53 
 
 		 386 aa  94  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.37 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.14 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.67 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.87 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.67 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.67 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.67 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.2 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.2 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.2 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.2 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.66 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.66 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.66 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.66 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.66 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.67 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.93 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.41 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.86 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.75 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 611 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  24.68 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.3 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.89 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  23.66 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.66 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  23.66 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.77 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.5 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.5 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.5 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.5 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.5 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.5 
 
 		 609 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.52 
 
 		 609 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.46 
 
 		 605 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  22.94 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.78 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  23.51 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 609 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.8 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.25 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.64 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.53 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  23 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  23.35 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  23.6 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.86 
 
 		 352 aa  57  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  25.96 
 
 		 589 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  25.76 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  22.41 
 
 		 715 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1031  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 386 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  23.91 
 
 		 614 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  23.91 
 
 		 614 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  22.41 
 
 		 767 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  22.56 
 
 		 660 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  25.96 
 
 		 589 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  24.52 
 
 		 659 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  21.74 
 
 		 660 aa  53.9  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 667 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 		 389 aa  53.5  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 668 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  24.05 
 
 		 484 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.05 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  21.08 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.6 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  26.5 
 
 		 605 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.6 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  22.37 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.6 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.6 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  25.96 
 
 		 589 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 573 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.68 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  23.17 
 
 		 674 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  25.61 
 
 		 589 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  25.79 
 
 		 601 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  26.03 
 
 		 589 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>