More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1614 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  56.82 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  37.5 
 
 		 259 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  44.09 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  45.1 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  40.71 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  43.62 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  41.9 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  39.42 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  44.12 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  40.95 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  43.81 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  43.81 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  42.86 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  35.38 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  44.79 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  44.68 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  41.51 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  42.06 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  41.35 
 
 		 112 aa  97.1  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  39.42 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  41.51 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  36.36 
 
 		 259 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  44.55 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.35 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  34.62 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  41.35 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  33.86 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  42.31 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  38.74 
 
 		 257 aa  95.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  41.9 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  43.88 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  41.35 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  41.35 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  43.56 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  41.9 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  38.68 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  36.36 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  40.57 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  37.96 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  38.38 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  38.78 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  43.53 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  35.48 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  38.78 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41.18 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  43.16 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  38.78 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  39.22 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  39.22 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  41.51 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  35 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  38.89 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  30.71 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  38.83 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  37.76 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  37.76 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  40.59 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.94 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>