More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1607 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 293 aa  597  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.553132 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  65.74 
 
 		 297 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1593  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.29 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.516871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.79 
 
 		 392 aa  236  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1605  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.11 
 
 		 382 aa  227  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.119603  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0675  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.34 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0185  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.73 
 
 		 335 aa  188  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.374978  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.28 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.630911 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1238  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.18 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  34.95 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  34.95 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  33.57 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  34.86 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  33.57 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  34.97 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  33.8 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  33.33 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  34.97 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  34.97 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  34.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  34.04 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  34.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  35.31 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  35.54 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  36.24 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  36.59 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  35.19 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  35.56 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  35.82 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  34.84 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  35.19 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  32.4 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  34.97 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  35.44 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  35.92 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  34.62 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  31.8 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  35.46 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  33.57 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  35.82 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  32.86 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  32.86 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  33.46 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  32.86 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  31.36 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  35.34 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  32.87 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  34.27 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  35.34 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  34.75 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  34.98 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  36.53 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  31.45 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  31.96 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  33.45 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  32.18 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  32.75 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  31.01 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  32.22 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  33.22 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  32.27 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  31.85 
 
 		 773 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  34.75 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  32.98 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  34.28 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  33.66 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  32.85 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  35.54 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  32.65 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  36.84 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  32.43 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  32.88 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  31.62 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  30.69 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.77 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  31.39 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.8 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  31.06 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  33.33 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  29.49 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.8 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  29.8 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  31.51 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  33.94 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.49 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  30.87 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  33.68 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>