62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1626 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 395 aa  756    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  38.1 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  21.59 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.71 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  36 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 405 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  35.11 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  34.38 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  32 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.55 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  33.75 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 413 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  31.11 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  35.9 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.71 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  26 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  35.9 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  30.38 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  31.11 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.87 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 456 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.87 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.42 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.42 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>