33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6511 on replicon NC_010504
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1010    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  34.14 
 
 
500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.08 
 
 
272 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.91 
 
 
286 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  26.2 
 
 
263 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  25.69 
 
 
328 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  24.91 
 
 
286 aa  86.7  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.91 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  28.87 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  27.83 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  28.43 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  23.37 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  23.98 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  29.13 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  30.21 
 
 
511 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  29.55 
 
 
290 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  30.24 
 
 
541 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  28.8 
 
 
511 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  28.8 
 
 
480 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  25.16 
 
 
906 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25 
 
 
484 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  28.96 
 
 
746 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  26.16 
 
 
325 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  25.49 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  25.72 
 
 
606 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  24.9 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2564  hypothetical protein  28.97 
 
 
243 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  30.85 
 
 
632 aa  47.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  25.53 
 
 
293 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  27.78 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>