211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6399 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6399  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
485 aa  964    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3568  peptidase M19 renal dipeptidase  79.9 
 
 
206 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  27.74 
 
 
311 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.82 
 
 
438 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  35.51 
 
 
307 aa  97.8  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  35.02 
 
 
393 aa  97.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  29.04 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  35.37 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.74 
 
 
328 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  35.35 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.7 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.93 
 
 
444 aa  90.1  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.89 
 
 
315 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.47 
 
 
333 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  30.04 
 
 
397 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.09 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.13 
 
 
311 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.53 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.91 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.78 
 
 
312 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.45 
 
 
344 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  29.92 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  29.6 
 
 
386 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.97 
 
 
342 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  34.29 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  33.92 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  34.81 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  33.72 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.24 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  33.33 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  29.63 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.28 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  27.8 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.34 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.83 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  32.12 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  28.53 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  29.48 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  28.87 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  27.84 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  28.83 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.84 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.68 
 
 
306 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  28.83 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  26.74 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.01 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  29.38 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  33.64 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27 
 
 
602 aa  77.8  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  29.31 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  25.1 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  27.62 
 
 
326 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  24.69 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  25.93 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.63 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  30.88 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.3 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  24.16 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  24.16 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  24.16 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.08 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  26.89 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  34.12 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  25.78 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  23.85 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  32.48 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.95 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  28.65 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  23.57 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  24.16 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  24.16 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.3 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  25.38 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  27.1 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  29.34 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  31.16 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  24.53 
 
 
329 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  28.68 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  25 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  24.92 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  29.35 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.44 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  33.5 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  25.19 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  31.22 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  27.64 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  22.75 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.97 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.9 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.03 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  26.61 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  22.99 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  22.61 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  27.81 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  24.61 
 
 
323 aa  67  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  27.49 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
418 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  27.47 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.23 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>