41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5600 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  100 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  82.47 
 
 		 158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  82.47 
 
 		 158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  81.41 
 
 		 158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  78.26 
 
 		 147 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  77.54 
 
 		 147 aa  220  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  59.03 
 
 		 162 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  54.93 
 
 		 210 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  47.62 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  54.46 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  55.17 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  45.97 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  54.39 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  53.51 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  47.75 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  45.95 
 
 		 118 aa  104  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  45.95 
 
 		 118 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  48.28 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  48.25 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  49.04 
 
 		 107 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  47.41 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  40.52 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  37.5 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  46.49 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  37.93 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  39.29 
 
 		 127 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  37.7 
 
 		 126 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  36.61 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  43.62 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  39.64 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  33.86 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  28.57 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  32.5 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  33.61 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  27.27 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  29.17 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  28.8 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  27.78 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  31.11 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>