29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4336 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  72.69 
 
 
249 aa  329  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  71.14 
 
 
249 aa  319  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  72.69 
 
 
249 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  62.9 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  63.16 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  66.67 
 
 
249 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  67.09 
 
 
251 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  60.48 
 
 
248 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  61.29 
 
 
250 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  68.03 
 
 
247 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  46.32 
 
 
243 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  36.21 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  55 
 
 
146 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  34.14 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  30.29 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  33.04 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27.39 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  31.2 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  30.86 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.92 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  29.1 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  26.57 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>