29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0353 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  100 
 
 
470 aa  945    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  34.35 
 
 
542 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  35.98 
 
 
341 aa  133  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  34.36 
 
 
275 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  31.85 
 
 
302 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2734  hypothetical protein  34.21 
 
 
251 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4010  hypothetical protein  33.76 
 
 
886 aa  94  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198206  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4205  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.295884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  31.56 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  31.56 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  30.71 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  30.53 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  28.87 
 
 
302 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  27.46 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0645  hypothetical protein  55.74 
 
 
159 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  30.34 
 
 
336 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  22.98 
 
 
296 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  24.23 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3179  ATP-dependent helicase HrpB  45.78 
 
 
127 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  28.37 
 
 
267 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  49.02 
 
 
194 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  45.65 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
284 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
282 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  29.31 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 
239 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  40.43 
 
 
298 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>