23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3898 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  100 
 
 		 177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  75 
 
 		 197 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  75 
 
 		 197 aa  279  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  42.29 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  34.86 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  30.77 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  32.79 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  35.09 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  31.07 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  26.37 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  27.43 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  28.57 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  29.94 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  25.88 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  24.57 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  25.71 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  21.18 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  27.01 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  28.98 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  22.98 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  25 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  25.5 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  34.21 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>