36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3271 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  88.76 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  89.41 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  64.63 
 
 		 82 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  62.2 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  56.92 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  40.74 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  42.11 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  46.77 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  50.91 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  40.24 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  47.3 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  47.3 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  46.77 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.74 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  49.06 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  40.68 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  53.66 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  40.35 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  43.55 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  40.28 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  39.47 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1508  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  38.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  37.25 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3517  hypothetical protein  33.87 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4213  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.742786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  32.84 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3810  hypothetical protein  31.75 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>