44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0967 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0967  putative CobE protein  100 
 
 		 140 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1035  putative CobE protein  73.64 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1162  putative CobE protein  74.07 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  59.85 
 
 		 184 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2445  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  59.06 
 
 		 171 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0185961  normal  0.116973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3122  putative CobE protein  60.94 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5686  putative CobE protein  56.45 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  42.31 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  43.8 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.84 
 
 		 612 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  42.98 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.09 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3261  putative CobE protein  46.28 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.89 
 
 		 368 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2375  putative CobE protein  46.02 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  40.16 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  34.65 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0807  putative cobalamin biosynthesis protein  48.8 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.82 
 
 		 598 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  38.89 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.9 
 
 		 574 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.16 
 
 		 577 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  37.7 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.32 
 
 		 547 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.71 
 
 		 398 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.13 
 
 		 258 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.1 
 
 		 365 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3183  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  37.23 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.06 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.56 
 
 		 425 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36 
 
 		 357 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.67 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.38 
 
 		 837 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  38.76 
 
 		 561 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.56 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3475  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.82 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1474  putative precorrin methylase  44.7 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2822  putative precorrin methylase  44.7 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0145  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.82 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.685754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.59 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  34.15 
 
 		 131 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  34.15 
 
 		 131 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.23 
 
 		 626 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.35 
 
 		 354 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>