More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3482 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  52.76 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  48.1 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.87 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  43.68 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.24 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  43.68 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  43.68 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  43.68 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.3 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
480 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  40 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0082  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.37 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.51 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.24 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  36.27 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 
471 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  48.1 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.46 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
558 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.04 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
480 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.82 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.77 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.21 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.56 
 
 
711 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  33.65 
 
 
201 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  40.54 
 
 
565 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  39.74 
 
 
356 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.67 
 
 
566 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.67 
 
 
566 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.05 
 
 
563 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000959863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 
459 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
175 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
356 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  39.74 
 
 
356 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 
356 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
361 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  40 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 
460 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  36 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.57 
 
 
820 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.05 
 
 
561 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  22.73 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.77 
 
 
198 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 
459 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>